Продолжение. Проявились в работе с программой AtmelStudio7 два косяка.
Делюсь бесценным опытом, потому как поначалу такие косяки выносят мозг капитально.
Первый не особо страшный.
Захотелось мне организовать передачу данных через USART на ПК. для этого установил Visual Studio 2015 бесплатную версию.
После установки AtmelStudio7 перестала работать как положено. Решилась задача переустановкой AtmelStudio7 на другой диск.
Второй конкретный косяк(более корректного слова подобрать не могу)
Перед закачкой кода AtmelStudio7 предложила обновить EDBG sam d20 Xplained Pro на более свежую версию 3.0
Я с дуру нажал Ок и при обновлении AtmelStudio7 вылетела, а плата осталась в режиме прошивки и моргала двумя диодами одновременно. После этого AtmelStudio7 никак плату не определяла. Что делать?
Написал на форум Atmel

И получил ответ.
http://community.atmel.com/forum/atmel- ... nt-1883941.
В кратце. В папках программы AtmelStudio7 есть файлы которые необходимо собрать в одну. Затем в командной строке набрать волшебное слово и о чудо! Свершилось!Плата засветилась одним зеленным огоньком и все работает как прежде.