Регистр TCNT во время прерывания

[KaiTheKat]

TCNT продолжает подсчет во время выполнения прерывания? Конкретно режим переполнения. Допустим по переполнению таймера сработало прерывание, TCNT сразу же продолжит подсчет или после выхода из прерывания?

[ARV]

само собой продолжает, это аппаратный счетчик. читайте документацию.

[rxstart1]

Если Вы хотите посчитать время импульса, то в обработчике прерывания значение TCNT нужно запихивать в переменную, которая отображает значение длины импульса, а следующей командой обнулить TCNT.