Есть ли для пиков чтото вроде avrdude с подержкой разного железа ?
Нужно достать память, загнать другую прошивку и вернуть память обратно. Вот мне кажется виллемский софт затрёт всё нафит нулями.
Ну в будущем чтоб извлекать эти данные для дальнейшей работы.

Ну и не совсем в тему. Реально ли прошить 2 контролера с разной прошивкой по одной шине чтоб городить меньше разъёмов?

Если для фирменного программатора, то у него есть своя программа, но там нет раздельного программирования памяти.
Для других версий программаторов есть разные программы, но будут ли они поддерживать новые МК...
Личное мое мнение, так сразу купить PicKit2 или PicKit3 и не иметь в дальнейшем проблем.
Считать прошивку в файл, потом подредактировать HEX-файл, например, программой PicHexEdit, а потом уже назад записывать...

С прошивкой 2-х контроллеров от одного разъема не получится, проще всего поставить второй разъем

Кароче понятно софта нет в природе. Остаётся искать исходники никсовой версии и собирать под cygwin .
Да уж пикари живут в 98 году и ничего нового с тех пор не вышло , старенькая однако платформа.
Вроде как у ардуины чтото было, но вроде как там только под пару новых процей