5K Ом. к +5В питания платы. Кнопки работают только в 1.09 от O-LED. В остальных прошивках при нажатии меняется яркость, но переключения не происходит.

Когда в полнакала горят, смотрите из-за чего?
может транзисторы на строки не закрыты или еще что-то
и фотку как в полнакала, есть надпись или что-то или все светитися

01 - отдельно строки и столбцы
02 - полный накал
03 - полнакала
надписей никаких нет.
Если бы транзисторы не закрывались, то строки и столбцы бы отдельно не работали?

Я подозреваю, что не правильно определился ОК / ОА
Определяется по резистору на порту PB2 - для ОК должна быть Единица
Видимо у Вас там Ноль, поэтому инверсия на матрицах, или утечка на кнопках или сопля какая-то

Уменьшить сопротивление до 1к ?

Нет, нужно проверить какое на этом порту напряжение (кнопки не нажимать), должна быть Единица
Если будут импульсы - то искать откуда они приходят

Может резистор не пропаян или не исправен или еще что-нибудь

Импульсы есть.
Сопротивление на +5В - 4,9к
На землю - 29К
Буду искать откуда они идут.
Между разомкнутыми кнопками - 2М
Буду искать причину.

Флюс

Еще раз промыл плату. Подал питание +5В.
На Vcc - +4.3В (питание идет через диод)
На PB.2 - +4.8В. Видимых скачков нет.
Результата нет. Сначала идет перебор столбцов и строк, кнопку нажал - полный накала, еще раз нажал - полнакала.

Между ногами меги флюс неотмыт - частая проблема
Пробуйте прошивку с кварцем, может двоить не будет и кнопки будут работать

В прошивках запутался. Какая мну нужна для 16 меги?
Попробую ещё мегу перепаять и hc595...

У Вас часовой кварц, ищите с часовым кварцем, лучше что-то из последних: это от uk8amk

Пробовал прошивку от 24AUG2014 для 16 меги единственная. Никакого изображения нет.

Ссылку на схему по которой плату делали так и не указали

По этой.

в этой схеме нет транзисторов
Если Вы ставили на столбцы транзисторы, то наверное нужно инвертировать вывод в прошивке на столбцы
Обычно столбцы подключаются к порту меги

Добавлено after 1 minute 16 seconds:

Они идут как усилители тока. Инвертирование не нужно.

Установил вместо 16 меги 32. Результаты тестирования прошивок:
1. Прошивки от O-LED работают, двоение не пропало.
2. Прошивки от uk9amk работают. На прошивках до 15 года есть двоение, 15 год - нет.
3. Прошивки alcxa не заработали (DS3231_DHT22_BMP180_4R-Link). Никакой индикации. Тестовая прошивка для 32 меги работает так же как и для 16 меги.

Ну так вместо часового кварца ставить RTC надо (DS3231) чтоб часики пошли

Понятно. А есть прошивка с часовым кварцем без наворотов для тестирования?