Ну и где подробно описано то, что ты делал, что бы получить желаемый результат?

Я менял резистор R2, потом заменил его на переменный. Менял конденсатор С2 от 1000 пф до 0,1 мкф, при каждом номинале прокручивал резистор. Увеличивая сопротивление лишние импульсы не пропадают, увеличивая ещё исчезают полностью. Чем больше емкость конденсатора тем при меньшем сопротивлении пропадают импульсы. Если убрать диод то лишние импульсы отсеиваются, но на выходах счётчика опять признаки того что счётчик не сбрасывается. Проверял микросхемы DD1, DD2 на исправность - рабочие. Замыканий на плате нет. Конденсатор С3 стоит древний, может в нём проблема? Я пробовал его отсоединять - результат тот же.

Вот тебе и нужно отловить эту пограничную зону с помощью С2R2 как можно точнее (желательно по осциллографу). Когда короткие импульсы команды уже не проходят, но на 8 выходе ДД1.5 еще присутствует"0". попробуй увеличить С3;R3. Эта RC цепочка не дает сбрасываться счетчику если проскочит одиночный случайный импульс из пачки. Если не поможет действие с R3C3, то тогда остается увеличить длительность паузы, оставляя неизменными длительность и частоту командных импульсов (попробуй раздвинуть пачки командных импульсов...на фоне бесконечной логической 1 раздвинуть пачки отрицательных командных импульсов).
Ну и дальше по кругу R2C2; R3C3. Короче, пляски с бубном.