Собрал преобразователь по схеме.
Работает. На выходе стабильно 3.26В
Но иногда напряжение падает до 2.1В, держится такое около 5 сек, а затем восстанавливается до 3.26В
Причём такой сбой происходит всегда через разное время: может произойти через минуту, может через 10, а может через 30

В момент просадки, что на входе, какой ток на выходе.
У МАХ1676 есть защита по току.
И что вообще питается от него.

Напряжение на входе резко падает до 1.10В
Затем плавно в течении 5...7 сек. понижается и когда достигает ровно 1.00В - восттанавливается.

Питается дозиметр (до 20 mA). Через каждые 10 сек. (на 0.25 сек.) включается генератор дозиметра (70 mA)

Пробовал менять дроссель
Пробовал поставить R4=43K, R3=68К
Пробовал ставить диод
Пробовал прогревать термофеном в работающем режиме (думал может что-то перегревается)
Поставил электролиты по 3300 мкф на вход и на выход
Ничего не дало результата.

Явно говорит о скачке потребления, вот и ищи откуда ноги растут.

А можно как-нибудь отключить защиту ?

А что это даст?

Надеюсь это решит проблему.

Когда преобразователь (схема в приложении) работает непрерывно, то никаких сбоев не происходит.
А когда переодически включается/выключается (постоянно держать включеным не экономично) , то через какое-то время происходит сбой.
Возможно защиту выбивает из-за цепи L1-Q1, но как это исправить - незнаю. Единственное что приходит в голову - отключить защиту.

Видимо происходит сбой в работе генератора на Q1-Q3, из за чего Q1 открывается и ток потребления возрастает.
Вот с этим и разбирайся, а МАХ тут похоже не при чём.