Случилась тут нежданная проблема - подох мой китайский Xilinx USB Cable. КОмпом в диспетчере устройств видится, target не видит и работать не хочет.
Внутри Cypress CY7C88013A + XC2C256 + Atmel AT24C128. Последняя содержит в себе конфигурацию для прогрузки в XC2C256.
Вот с ней то и проблемы, как выяснилось, в один прекрасный момент она.... все забыла. Т.е. чистый дамп FF по всем 16 кбайтам. Притом что флешка сама живая, прошить и сравнить - без проблем.

Девайс очень распространенный у тех, кто занимается Xilinx. Покупать новый из-за такой ерунды не хотелось бы. Может найдется владелец такого прибора, кто не поленится считать дамп из AT24C128 (ATMLH322 - маркировка на самой микросхеме) и прислать его мне. Буду крайне благодарен за этот акт взаимопомощи!

К сожалению, я ошибся, в этой флешке записано лишь несколько байт, вероятно какая то конфигурация устройства. Я сравнивал с присланным мне дампом из рабочего устройства - содержимое то же самое. Флешку на 128КБит поставили наверное потому что такие были в наличие, используются там несколько байт.